两年之后，鸣人已经和成年人的身高一般无二，实力方面也从自来也那里学到了不少东西，还有半年左右就该回木叶了，但是鸣人最感兴趣的仙术自来也却没有交给他，经过一番软磨硬泡，透支了所有积蓄请自来也喝了一个月的花酒，终于让自来也点头。
两年来，自来也不仅仅是为了锻炼鸣人，更重要的是想考察鸣人的心性，通过观察，自来也觉得鸣人是值得信赖的，而且想到鸣人巨大的潜力，他认为鸣人完全能够超越四代火影，所以在收了鸣人的贿赂后，决定让鸣人修炼仙术。
来到传说中的三大仙地之一的妙木山，干净的自然环境是带给鸣人的第一印象，在深作和自来也的监督下，鸣人开始了仙术的修行。
仙术说白了，就是吸收自然能量融合进自身，困难之处在于必须保持自然能量和自身能量的平衡，稍有不慎就会变成青蛙并且石化，当然各仙地的仙术有所不同，不能控制自然能量的后果也不尽相同。
鸣人在深作和自来也的帮助下成功的学会了吸收自然能量，并且能够达到更好的平衡，不过和原著一样，进入仙人模式需要静止状态，而且独自使用只能维持五分钟，想要持久作战，必须要和深作、志麻合体，当然现在的鸣人不存在九尾排斥而不能合体的情况。
对于这一情况，鸣人并不满意，他知道千手柱间可是能瞬间进入仙人模式，并且能够独自持久的战斗，而且兜在后来也掌握了龙地洞的仙人模式，持续的时间也很久。
逐渐熟悉了仙人模式，鸣人对于自然能量也有了更清晰的认识，他发现自己吸收的并不是所有的自然能量，只是其中的某一部分，他猜想这就是各种仙人模式的不同之处，自己通过蛤蟆油让身体熟悉了其中一种能量，身体熟悉了，自然能够吸收，但是其它的自然能量依旧排斥鸣人。
想到这一可能，鸣人就去询问了深作，得到了肯定的答案，告别了深作之后，鸣人开始了思考解决办法，他想要将妙木山仙术的缺点抹去。
再次进入静止状态，鸣人想要感应到更多性质的自然能量，不过他发现这是一件很困难的事情，他能感应到无所不在的自然能量，除了他能吸收的，余下的和他没有半点反应。
鸣人不信邪，他回到了仙术修行的原点，想要和更多性质的能量产生呼应，想要做到这一点十分困难，不过鸣人有时间和精力，他坚信自己一定能成功。
自来也能交给鸣人的东西已经不多了，而且现在鸣人沉浸在仙术的修行中，这一方面妙木山的蛤蟆就能帮忙，所以自来也决定离开妙木山，继续出去打探情报，最近晓组织越来越活跃，自来也不可能不去关注。
和联络蛙打过招呼，让它在鸣人完成修行后通知自己，自来也就离开了妙木山，他没有去打搅鸣人，只是决定在鸣人熟悉了仙人模式后将他带回木叶，这也是当初和纲手的约定。
大自然具有很神奇的力量，能够轻易的改变地形，也能带来一场毁灭性的灾难，想要掌控所有的自然能量，那是不可能的事情，就算是被誉为忍者之神的千手柱间，也不能做到这一点，况且时间和空间也同样属于自然能量的范畴。
虽然不能和所有性质的自然能量呼应，但是通过半年时间，鸣人也已经掌握了好几种性质的能量，现在的他进入仙人模式，不在需要静止状态，所需要的时间虽然不能和千手柱间相比，但是也相差无几，持久性也得到了很大的提升。
“鸣人，现在的你已经超越了四代，甚至超越了我，想到你才十几岁，真是让我感到汗颜啊！不过现在我们也该回去了。”得到消息的自来也找到了鸣人，无不感叹的说到，同时也决定带鸣人回木叶。
“啊，是时候回去了。”掌握了更强大的仙术，让鸣人充满了自信，他开始期待和晓的再一次相遇了。