魔卡少女樱讲的是一个叫木之本樱的小姑娘收集库洛牌，最后成为最厉害的魔法师的故事。故事前半截是讲述木之本樱收集各种卡片，后半截则是小樱在艾利欧故意制造的各种事故中，将库洛牌转化成樱牌的故事。这个故事中有初代萌神小樱、引发塔罗牌占卜热潮的库洛牌、贯穿许多故事中的幕后人物库洛里多、许多腐女的及百合入门cp。
祁宇就留在木之本家，开始最基础的魔力训练。其项目，也就是冥想增加魔力，以及精细化控制魔力这两项。此时的小樱已经知道需要将库洛牌转化成小樱牌。为了转换库洛牌，庞大的魔力和精细的操控是必须的，凌就是艾利欧找来教导小樱的人。
桃矢在观察了一阵子之后，也加入了训练的行列。桃矢空有力量却不知道怎么运用，这让他无力了很久。这个妹控早就不满自己妹妹陷入危险去收集什么劳什子牌了。现在看见有比较靠谱的人教导，自然也跟着学。
不学白不学，就算不如小樱这个已经使用过魔法的人学的快也没什么丢脸，不是还有个祁宇垫底吗？
祁宇表示他一点也不想成为桃矢的比较对象。
祁宇在木之本家呆了一个月，开学之后，神通广大的凌就办好了入学手续，让祁宇跟着桃矢和雪兔进了星条高校。这段时间，木之本家也真的完全接纳了祁宇，把祁宇当做了家人看待。
这人与人之间的关系就这么奇怪。一向对人际关系很警惕的桃矢，第一眼就觉得祁宇是个可以深交的人。而拥有“怪兽直觉”（小樱：哥哥你讨厌！）的小樱，更是粘祁宇粘到桃矢都吃醋的程度，连小樱最喜欢的雪兔哥都靠边站了。
嗯，吃醋的不只是桃矢，还有一个同样是中国人的小屁孩。
祁宇也觉得很奇怪。他对自己那德行是再了解不过。上一辈子敞开心扉的人就少之又少，这一辈子可以说就只有爷爷奶奶，甚至有时候爷爷奶奶也觉得有些隔阂——都是穿越惹的祸。但是在小樱面前，他总是不自觉的柔和下来，放松心底防线。似乎看着这个名字叫樱的女孩，那如同樱花般灿烂的笑脸，连他自己阴暗的内心，都变得光明了似的。
“你有一个好妹妹。”祁宇如是对桃矢说。
“那个小怪物。”桃矢嗤笑，满脸得意。
“所以我决定抢走她。”祁宇一本正经，“我会成为她心中最重要的哥哥，你靠边站吧！”
“……”桃矢扔下笔，拖着祁宇的领子出门决斗。
“噗……”雪兔捂着嘴偷笑，“他们感情真好。”
“两个笨蛋。”穿着向日葵布偶装的凌一脸嫌弃。
“不过你来学校，居然老师看见也不说。”雪兔看着把自己下半身埋进花盆的凌笑道。
“我只是一株向日葵而已。”凌很正经的回答。
“……”雪兔愣了一下，“好吧。”
“雪兔的人格和月的人格要合一了吧。”凌突然转换话题。
“……”雪兔沉默了一会儿，微笑道，“本来就是一个人，不过是共享记忆，影响性格而已。”
“合一需要强大的魔力支撑，你是‘月’，‘月’不能自己产生魔力。小樱的魔力还不足以你们完成融合吧。”凌叹道，“你们再晚一点就好了。”
“这是无法控制的。”雪兔将书本合上，望向窗外。
祁宇现在很忙很忙，为了赚零花钱（凌虽然有钱但总不能老是用他的吧），祁宇每周都要去远房表亲家给表妹美墨渚补课——由此他认识了初代光之美少女黑·天使≈白天使，外带光之国小萌物三只。凌的魔法训练自然不可能停，祁宇每周还要抽出一天去接受另一个鬼畜婴儿虐待——凌说reborn的收费可是很高的，祁宇需要满怀感恩的接受另一个鬼畜婴儿的蹂躏。
这时候，那个鬼畜婴儿还没有成为未来的十代目的老师，而是在友枝町忙什么工作，就住在小樱家附近。而加入reborn的训练的还有桃矢，这个妹控真是不放过任何可以变强的机会，让消极怠工的祁宇也不得不拿出十二分的努力，特别是连小樱也加入之后。
小樱真是个很努力的好孩子，一点也不怕苦不怕累，再加上本来运动细胞就很发达，嗯，神经也很大条，对reborn的魔鬼训练一点也不害怕。
不久之后，渚和穗乃香——也就是光之美少女黑·天使和白天使也加入进来。她们自从知道小樱是魔法少女之后就和这个魔法少女小妹妹有了联系，关系越来越好，还能互相探讨力量的运用。而小樱知道她们两就是和怪物对抗的光之美少女，简直崇拜的不能再崇拜，她和知世简直把渚和穗乃香当做亲姐姐一样看待了。
说起reborn，就不能不说沢田纲吉。纲吉目前才初一，离reborn训练他还有近一年。这时候彭格列的几个继承人还活的好好的，reborn也只是单纯的来日本办事，顺便应老友沢田家光的请求看一看他的妻儿是否安全，若有什么，出手肃清一下而已。但是reborn发现，貌似这沢田纲吉废材的太不靠谱了。reborn一次和家光无意间说起纲吉的事，家光便拜托很有家教经验的桃矢和祁宇给纲吉补课。
他们两都是普通人，嗯，表面上是，和纲吉见面没关系。他知道纲吉没有男性长辈的教导，性子很懦弱，他也很心疼，却不知道该如何是好。他认识的人都是黑手党那个圈子，或者和黑手党圈子有关联的，而并盛町也不是个普通的地方。不过若是凌这个连九代目都说神秘的人物的学生，应该没问题吧。
但祁宇知道，现在这个被保护在黑手党圈子之外的懦弱孩子，以后将是合格的彭格列十代目。和他结识，就代表着无穷无尽的麻烦。
可他还没考虑好，桃矢就带着他三个妹妹，呃，加上知世，四个妹妹，去拜访沢田家了otz。
“沢田君一直没有父亲照顾，好可怜。”小樱眼泪汪汪，作为没有妈妈的孩子，她知道单亲家庭的痛苦。何况沢田君少的还是父亲，家里的顶梁柱。
“嗯，小樱没有妈妈照顾就变得像个男孩子一样鲁莽，好吧，这样至少不会被欺负。”桃矢挡住小樱气愤的小拳头，“沢田没了父亲，自然比女孩子还懦弱，既然是reborn老师好友的孩子，能照看一下肯定要去。”
“我也对那个孩子很好奇呢。”知世捧着脸，“照片好可爱，好想让他穿上我做的衣服啊！”
“喂喂，知世，你做的衣服都是女装吧？”祁宇忍不住吐槽。
“对了祁宇哥，你不是要做成为魔法少女的准备码？我可以先帮你做衣服帮你做好穿女装的适应哦。”知世眼睛中出现亮晶晶的星星。
“不……不用了，谢谢……”祁宇忍不住后退。
“不知道沢田君比起我的成绩如何。”原来渚你是想找安慰啊……
“我的成绩也不错，可以帮忙。”穗乃香是个好孩子。
“唉……”祁宇跪趴了。他又不能透露未来，说纲吉以后将会成为彭格列的十代目，身边充满着争宠（？）的灾难天气，麻烦不断吧？就算魔法师能够预知未来，但是这种世界“主角”的命运线是其他人所看不到的，他也不能泄露啊！
“祁宇？”凌似笑非笑。
“去吧去吧。”祁宇蹲在地上，很颓废的抓抓头发。
“你不是很怕麻烦吗？”凌用脚尖轻轻的踢了踢祁宇的屁股。
“但是没办法啊，连妹妹们都要去。”祁宇更颓废了。
“呵……”凌眯着眼睛。
于是可怜的祁宇，就这么和桃矢带着四个妹子来到了并盛町。雪兔这次并没有和桃矢形影不离。他的身体越发不行了，离开了友枝町会恶化的更加快。不过这件事肯定不能和小樱说，以免小樱自责。虽然也没有和桃矢说，但是桃矢大概已经猜到了一些，训练也更加的积极。
当遇到纲吉的时候，说实在的，现在的纲吉并不算多么讨人喜欢。他实在是太自卑了，自卑到自暴自弃了。
被封印之后，纲吉的注意力记忆力平衡力一下子下降了太多，成为“笨孩子”。没爹的孩子会被人欺负，笨拙的孩子会被人欺负，所以纲吉是被欺负长大的。再加上善良的纲吉从来不想让奈奈担心，于是奈奈也不知道纲吉被人欺负。
事实上，一个人不断被人说废材，哪怕他是可造之材，也会成为真正的废材。这算是一种催眠。
一年之后，reborn会摧毁这种催眠。而现在，祁宇等人也能。